（一）申請時間
1.需審批扣除的資產損失：納稅人應在年度終了45日內，向主管稅務機關報送相關資料。
2.自行申報扣除的資產損失：納稅人應在進行年度申報前，向主管稅務機關說明有關情況。國稅發[2009]88號文件第十條的規定“企業發生屬于由企業自行計算扣除的資產損失，應按照企業內部管理控制的要求，做好資產損失的確認工作，并保留好有關資產會計核算資料和原始憑證及內部審批證明等證據，以備稅務機關日常檢查。”
(二)審批扣除需報送的資料
1、書面申請；
2、企業資產損失申請表（請按填報說明進行填寫）；
3、企業法人、企業負責人、企業財務負責人對申報的資產損失事項真實性承擔法律責任的聲明；
4、具有法定資質的中介機構（事務所）出具的鑒證報告；
5、其他應按國稅發〔2009〕88號文件相關條款規定的資料。
（三）企業主管稅務機關資產損失審批權限劃分
1、以下各類資產損失單筆損失金額在2000萬元（含）以上的，由所得稅科直接受理、審批、主管局長終審；單筆損失金額在2000萬元（不含）以下的，由稅務所進行受理、審批并終審：
（1）抵押資產損失；
（2）金融企業壞賬損失；
（3）金融企業銀行卡透支；
（4）金融企業助學貸款；
（5）股權投資損失；
（6）股權轉讓損失；
（7）委托貸款損失；
（8）委托理財損失；
（9）擔保損失。
2、以下各類資產損失無論金額大小，均由稅務所進行受理、審批并終審：
（1）現金損失；
（2）銀行存款損失；
（3）壞賬損失（應收、預付）；
（4）存貨盤虧損失；
（5）存貨報廢、毀損、變質損失；
（6）存貨被盜損失；
（7）固定資產盤虧、丟失損失；
（8）固定資產報廢、毀損損失；
（9）固定資產被盜損失；
（10）在建工程停建、廢棄、報廢、拆除損失；
（11）在建工程自然災害、意外事故損失；
（12）工程物資損失；
（13）生物性資產盤虧損失；
（14）生物性資產森林病蟲害、疫情、死亡損失；
（15）生物性資產被盜伐、被盜、丟失損失。
（四）特別提示
根據《國家稅務總局關于企業股權投資損失所得稅處理問題的公告》（國家稅務總局公告2010年第6號）有關規定：企業對外進行權益性（以下簡稱股權）投資所發生的損失，在經確認的損失發生年度，作為企業損失在計算企業應納稅所得額時一次性扣除。
2010年1月1日以前，企業發生的尚未處理的股權投資損失，按照《國家稅務總局關于企業股權投資損失所得稅處理問題的公告》（國家稅務總局公告2010年第6號）有關規定，準予在2010年度一次性扣除。