中小企業在規模、組織結構和業務管理等方面與大企業有不同的特點，因此在構建內部控制體系時，不能簡單照搬大企業做法，為幫助小型公司建立高效經濟的財務報告內部控制制度，COSO在2006年6月份發布《小型上市公司財務報告內部控制指南》。
　　一、中小企業內控與大型企業內控特點的差異
　　中小企業一般規模較小，盈利能力有限，更加關注增加企業收入、降低生產成本、擴大市場份額等指標，對于不能立即帶來經濟效益的內控工作不夠重視。與大型企業相比，中小企業內部控制具有以下特點：(1)人員較少、組織結構相對簡單，一個員工可能同時兼任幾個崗位，并且崗位的職權職責往往比較模糊，不相容職責分離難以有效保證;(2)管理層往往更加重視經營，對財務報告內部控制不夠重視或不太熟悉;(3)過于依賴核心人員，企業的資源掌握在關鍵人員手上，較多依賴人治而不是制度治理，缺乏系統性的內控制度和流程;(4)一般沒有獨立的內審機構，對內控問題和缺陷無法獨立、系統地監督評價;(5)由于資源有限，計算機信息系統往往不夠完善，并缺乏有效的控制。
　　二、我國中小企業內部控制常見問題及對策
　　現階段我國許多中小企業在內部控制方面存在諸多問題，筆者從內部控制五要素出發，結合工作實踐，認為中小企業內控典型問題有：
　　(一)內部環境
　　1.異地分支機構管控薄弱。近年來，企業異地分、子公司時有以下問題出現：私自對外借款或挪用公司款項、侵占銷售貨款、私設小金庫、虛增費用少計收入等等。外地機構因為地域、人員和管理成本制約及管理幅度和深度不足等原因，使得其存在極大的風險。中小企業須對外地辦事處、分公司、子公司做好以下工作：加強內控建設，完善財務會計核算體系;嚴格控制對外融資、擔保權限，加強投融資的管理;審核發展戰略;加強預算管理的編制和執行情況;在子公司章程中明確約定子公司的業務范圍和審批權限等。
　　2.中小企業用人易出現“任人唯親”的現象。在中國人的傳統觀念中，總是易信賴親近的人，尤其在創業之初，親近的人更能同甘共苦，這也讓中小企業主更加傾向任用親近的人。殊不知，這些親近的人卻未必真的能靠得住。一個企業的長久發展需要一套行之有效的管理制度和健全的內控體系來支撐，而不是靠親戚關系來維系。企業內控指引要求：企業應遵循德才兼備、以德為先和公開、公平、公正的原則，通過公開招聘、競爭上崗等多種方式選聘優秀人才。一個企業如果喜歡“任人唯親”，將錯失很多優秀人才，而人才恰恰是一個企業最重要的生產力，沒有優秀的人才，該企業注定走不遠。