1、注重賬簿審計的同時，千萬別忽視實際項目的審計。

　　審計往往只是將被審計單位的專項資金收支總賬、明細賬和記賬憑證等會計資料送達審計組，審計完后即為審計結束。即使到實地查看工程，也是走馬觀花，沒有認真丈量、記錄，也沒有計算材料實際用量與賬面決算數所使用數量是否一致，看是否有高估冒算或實際使用量小于決算量的現象。

　　2、注重賬面的收支憑證的同時，千萬別忽視銀行票據的審計。

　　專項資金審計的傳統方法是看賬面收支憑證是否合理、合法、合規，而對銀行票據的真實性和銀行對賬單的核對工作容易忽視。由于某些配套資金不能足額到位，多數采用配套資金空運行方式，即真撥付、后轉回、賬面反映配套資金到位了，而實際上根本沒有到位，在實際工作中，只要查閱開戶行銀行對賬單所反映的收支明細與被審計單位銀行賬收支欄目，就可能反映同等金額的一收一支，而且時間相近；還有一種情況是被審計單位賬上反映現金增加而銀行對賬單沒有記錄付出，則采用現金支票存根聯入賬，提款聯沒有取款、主觀上也不想取款，客觀上也無款可取。只要重視加強對銀行票據系列的審核力度，弄虛作假的現象便一目了然。

　　3、重視資金使用的同時，千萬別忽視資金使用效益。

　　主要看在建工程項目借方數或專項支出數，累加后與上級下達計劃指標進行對比，看資金是否全部支出，全部支出即視為專項資金專款專用，沒有被擠占、挪用，忽略了該項資金的使用經濟效益，有的即便在審計報告中有所反映，也總是很勉強，其數據不夠準確真實。形成的主要原因：一是某些地區或部門為了爭取上級專項資金早日投入，項目立項具有盲目性、隨意性，缺乏對當地經濟社會等現實環境的可行性論證，從而降低了資金使用效益；二是工程項目竣工時間較短，還沒有發揮應有的作用，效益不明顯；三是由于審計人員少，時間短，根本不可能深入實地調查了解，往往是“從書本到書本”的反映效益。

　　4、注意資金到位率的同時，千萬別忽視資金到位的時間性。

　　在對各項專項資金審計中，審計人員總是查找上級財政部門和主管部門聯合下達的專項資金的指標文件，然后與同級財政部門專項資金額進行對比，計算資金到位率，比例大則資金足額到位，比例小則到位小，并在審計中予以評價。但是，較多當年下達的專項資金的指標，由于財力有限調劑其他用途，下撥渠道不暢等，拖欠到年底，有的甚至到第二年底才勉強撥付完畢，資金到位時間遲緩，嚴重影響工程項目設施建設。

　　以上四個環節的審計是一個有機的整體，應同等對待，相互對應，互為牽制。這樣才能在專項資金審計中客觀、公正、真實地反映資金收支的全貌。