一、預(yù)算測控法。是指從財(cái)政預(yù)算分配入手，通過詳查預(yù)算分配方案，測算評(píng)估各種專項(xiàng)資金支出比例、結(jié)構(gòu)、用途是否合法合理的方法。運(yùn)用此種方法，對(duì)本級(jí)政府安排的專款，可以查清是否按政策足額預(yù)算，是否按人大批準(zhǔn)的預(yù)算安排資金，有無用于其他方面或沒有完成預(yù)算。對(duì)上級(jí)安排的專款，如支農(nóng)扶貧資金等，可以查清配套資金是否到位。尤其是對(duì)社保基金審計(jì)較適用，如現(xiàn)行法規(guī)沒有明確規(guī)定各級(jí)財(cái)政社會(huì)保障預(yù)算安排的硬性比例，基層財(cái)政年初安排的指標(biāo)弱化，執(zhí)行預(yù)算時(shí)又存在隨意性。運(yùn)用上述方法既節(jié)約審計(jì)成本，又能弄清以下問題：一是財(cái)政部門年初向人大上報(bào)的社會(huì)保障預(yù)算支出比例、結(jié)構(gòu)是否合理，資金的分配是否按現(xiàn)行的原則。二是執(zhí)行預(yù)算時(shí)有無混淆中央專項(xiàng)補(bǔ)助指標(biāo)與本級(jí)預(yù)算安排指標(biāo)的問題，有無將中央專項(xiàng)補(bǔ)助資金改變用途或平衡預(yù)算。三是財(cái)政決算時(shí)，有無截留社會(huì)保障支出指標(biāo)，掛無項(xiàng)目、無部門的下年結(jié)轉(zhuǎn)科目問題，上報(bào)的決算報(bào)表是否帳表一致、真實(shí)可靠。
　　二、多重結(jié)合法。指專項(xiàng)審計(jì)與專項(xiàng)調(diào)查、財(cái)務(wù)收支、經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)或其他審計(jì)項(xiàng)目有機(jī)結(jié)合，便于從多角度、多層次發(fā)現(xiàn)、跟蹤線索查證事項(xiàng)的方法。一是與同級(jí)財(cái)政審計(jì)相結(jié)合。重點(diǎn)審計(jì)財(cái)政部門對(duì)上級(jí)撥入、本級(jí)政府年初預(yù)算安排的專項(xiàng)基金是否及時(shí)足額到位，是否撥入財(cái)政專戶進(jìn)行管理并及時(shí)分配下?lián)埽瞬橛袩o不按政策規(guī)定分配、超范圍撥付、滯留未撥、虛列支出、擠占挪用、截留轉(zhuǎn)移或用于平衡財(cái)政預(yù)算等問題。揭示缺乏專項(xiàng)資金預(yù)算的種種弊端和專項(xiàng)資金轉(zhuǎn)移支付行為中不合法、不合理、不公開、不規(guī)范的問題。二是與審計(jì)調(diào)查相結(jié)合。專項(xiàng)資金涉及部門多，覆蓋面廣，使用分散，要把一個(gè)縣的專款自上而下全部審計(jì)，客觀上沒有必要，也受審計(jì)資源限制。為了節(jié)約審計(jì)成本，對(duì)全縣所有專款實(shí)施審計(jì)調(diào)查，對(duì)縣級(jí)財(cái)政、主管部門管理的專款實(shí)施全面審計(jì)，對(duì)鄉(xiāng)鎮(zhèn)、建設(shè)單位管理的專款實(shí)施抽樣審計(jì)。這樣有利于擴(kuò)大審計(jì)覆蓋面，提高審計(jì)質(zhì)量與效益，既可把握資金管理質(zhì)量和總量，又可掌握資金使用的實(shí)際情況，既可查出資金管理中存在的問題，又能考核資金使用的整體效益。三是與財(cái)務(wù)收支審計(jì)相結(jié)合。目前，有些單位的專款沒有建立專帳，而是與單位經(jīng)費(fèi)放在一起核算，只有將專項(xiàng)資金審計(jì)與財(cái)務(wù)收支審計(jì)有機(jī)結(jié)合，才能分清專款來源與經(jīng)費(fèi)來源、專項(xiàng)支出與經(jīng)費(fèi)支出，確認(rèn)經(jīng)費(fèi)與專款是否存在打通使用的現(xiàn)象，確認(rèn)經(jīng)費(fèi)是否擠占了專款。四是與經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)相結(jié)合。有利于加強(qiáng)對(duì)領(lǐng)導(dǎo)干部權(quán)力的制約和監(jiān)督，增強(qiáng)其專款管理的責(zé)任意識(shí)。如將專項(xiàng)支出預(yù)算、社保費(fèi)征收率、投入產(chǎn)出率、投資回收期等指標(biāo)分別作為財(cái)政、地稅、其他部門、單位負(fù)責(zé)人任期考核指標(biāo)之一，對(duì)擠占挪用專款用于消費(fèi)的；監(jiān)管不到位造成“豆腐渣”、“半拉子”工程的；投資產(chǎn)出率、投資回收期較大幅度低于正常水平的；以種種理由或“借口”不給職工投保或少投保的、有繳費(fèi)能力又惡意欠費(fèi)的單位負(fù)責(zé)人依法追究責(zé)任。